Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNG1Q06432 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNG1Q06432 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms