Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms