Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEUP1Q05D60 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms