Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTDSPL2Q05D32 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms