Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN12Q05209 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN12Q05209 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms