Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NHLH2Q02577 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms