Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFRSF17Q02223 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms