Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 409.5 ms