Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms