Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDC42EP1Q00587 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms