Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms