Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMF1P82094 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms