Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IFI35P80217 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFI35P80217 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFI35P80217 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFI35P80217 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFI35P80217 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms