Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HBBP68871 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HBBP68871 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HBBP68871 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HBBP68871 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HBBP68871 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HBBP68871 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HBBP68871 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HBBP68871 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HBBP68871 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms