Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG2P63267 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms