Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms