Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS3AP61247 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms