Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF3P61204 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARF3P61204 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARF3P61204 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms