Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GMFBP60983 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms