Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB25P57735 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB25P57735 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB25P57735 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms