Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN15P56746 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms