Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO3P55854 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms