Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP9P55211 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP9P55211 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms