Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
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PGGT1BP53609 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PGGT1BP53609 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGGT1BP53609 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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