Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDST1P52848 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDST1P52848 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDST1P52848 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDST1P52848 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDST1P52848 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDST1P52848 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDST1P52848 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDST1P52848 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDST1P52848 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDST1P52848 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDST1P52848 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDST1P52848 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDST1P52848 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms