Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms