Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPIAP49247 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPIAP49247 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPIAP49247 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms