Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNNI2P48788 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms