Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ME1P48163 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ME1P48163 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ME1P48163 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ME1P48163 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ME1P48163 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ME1P48163 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms