Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRB2P47870 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRB2P47870 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms