Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IQGAP1P46940 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IQGAP1P46940 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms