Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTHFRP42898 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFRP42898 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms