Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC1P41238 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms