Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZEB1P37275 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZEB1P37275 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms