Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LTBRP36941 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LTBRP36941 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms