Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN2P35609 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms