Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA4P35212 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJA4P35212 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJA4P35212 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA4P35212 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms