Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGER1P34995 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms