Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD40LGP29965 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD40LGP29965 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms