Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CRABP1P29762 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms