Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCHP24723 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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