Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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