Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRBP23467 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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