Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms