Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGCP20142 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGCP20142 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms