Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDCP19113 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDCP19113 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDCP19113 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms