Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IL7RP16871 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL7RP16871 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL7RP16871 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms