Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms