Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NCK1P16333 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCK1P16333 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms