Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG2P13727 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRG2P13727 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms